Колекційний фонд Ботанічного саду складає близько 5000 таксонів, які включають:

  • 1025 видів і форм дерев і кущів;
  • 720 природних трав`янистих видів;
  • 1095 видів і сортів культурних трав’янистих рослин;
  • 1630 видів тропічних і субтропічних рослин.

Спонтанна флора ботанічного саду налічує 489 видів.
Унікальними в ботанічному саді є колекції саговиків, пальм, антуріумів, сукулентів, плющів, інших тропічних і субтропічних рослин, рододендронів (друга за об’ємом колекція в Україні), хвойників, ботанічна система, рідкісні декоративні рослини, півники, лілійники, жоржини. У колекціях Ботанічного саду знаходяться рідкісні та зникаючі види рослин, 64 види з Червоної книги України, що включають 12 ендеміків і 17 реліктів.

КОЛЕКЦІЇ ВІДДІЛУ ПРИРОДНОЇ ТРАВ`ЯНОЇ ФЛОРИ

У відділі опікуються трав’яними видами рослин природної флори відкритого ґрунту.
У колекціях відділу налічується 720 таксонів з 110 родин:

  • колекція систематики рослин (194 таксони) – куратор  Марія Надрага
  • колекція водно-болотних рослин (192 таксони) – куратор кандидат біологічних наук Любов Борсукевич
  • колекція «Карпатарій» (166 таксонів) – куратор Марія Надрага
  • колекція лікарських рослин (262 такосни) – куратор кандидат біологічних наук Марія Скибіцька
  • колекція степових рослин (59 таксонів) – куратор кандидат біологічних наук Любов Борсукевич
  • колекція ужиткових рослин (55 таксонів) – куратор Мирослава Гелеш

КОЛЕКЦІЇ ВІДДІЛУ ДЕНДРОЛОГІЇ

У відділі опікуються двома дендропарками (вул. Кирила і Мефодія, 4; вул. Черемшини, 44), де зосереджена значна частина колекційних фондів. Окрім цього у відділі працюють над розвитком спеціалізованих дендрологічних колекцій.
У колекціях відділу дендрології 1025 таксонів з 72 родин, з них аборигенних видів – 167, інтродуцентів – 858:

  • колекція рододендронів (125 таксонів) – куратор кандидат біологічних наук Галина Тимчишин
  • колекція декоративно-квітучих кущів (341 таксонів) – куратор Оксана Щерба
  • колекція хвойних рослин (205 таксонів) – куратор Марина Щербина
  • колекція витких рослин (73 таксони) – куратор Лідія Степась
  • колекція магнолій ( 25 таксонів ) – куратор Лідія Степась

КОЛЕКЦІЇ ВІДДІЛУ КУЛЬТУРНОЇ ФЛОРИ І ОЗЕЛЕНЕННЯ

У відділі опікуються колекціями квітниково-декоративних рослин, що нараховують1095 таксонів. Принцип їх розміщення відповідає основним життєвим формам трав’янистих рослин: цибулинні, бульбоцибулинні, кореневищнi багаторічні, дворічні, однорічні, а також розарій. В експозиціях розміщені провідні у декоративному садівництві культури – тюльпани (157 сортів), гіацинти (34 сорти), жоржини (138 сортів), гладіолуси (41 сорт), іриси (145 сортів), флокси (26 сортів), хризантеми (127 сортів), півонії (49 сортів), троянди (74 сорти).
У колекціях малопоширених багаторічників 280 видів та 212 сортів з 56 родин і 175 родів. Представлені декоративні види Європи – 90; Далекого Сходу і Японії – 49; Центральної і Малої Азії – 50; Північної Америки – 31; Кавказу – 27; Середземномор’я – 24; Карпат – 20, Криму – 30

  • колекція багаторічних декоративних рослин – куратор кандидат сільськогосподарських наук Марія Могиляк
  • колекція цибулинних рослин і жоржин – куратор Ядвіга Федоровська
  • колекція хризантем, півоній і однорічних культур – куратор Наталія Загульська
  • колекція півників і флоксів – куратор Ядвіга Федоровська
  • колекція троянд – куратор Ядвіга Федоровська

КОЛЕКЦІЇ ВІДДІЛУ ТРОПІЧНИХ І СУБТРОПІЧНИХ РОСЛИН

У відділі опікуються колекціями тропічних та субтропічних рослин, які було засновано ще в 50-х роках ХІХ століття. Старі теплиці на вул. Кирила і Мефодія, 4 функціонують і зараз, тут знаходиться низка колекцій відділу, зокрема ароїдних, бромелієвих, драценових, орхідних та пальм. В 70-х роках ХХ ст. був збудований оранжерейний комплекс загальною площею 1250 м2, де розміщені основні експозиції відділу на вул. Черемшини, 44.
Колекційні фонди відділу налічують 1630 таксонів, що включають 1306 видів та 324 внутрішньовидових таксони і належать до 474 родів, 135 родин, 5 відділів. Основні колекції розташовані за ботаніко-географічним та систематичним принципами.
У 2002 році колекція занесена до Державного реєстру наукових об”єктів, що становлять національне надбання України.
 
Відділ Magnoliophyta представлений 1575 таксонами.
Клас Magnoliopsida (917 таксонів)
Найбільші за кількістю родини: Cactaceae – 206,Crassulaceae – 167, Araliaceae – 75, Euphorbiaceae– 46, Moraceae – 43.
Клас Liliopsida (658 таксонів)
Найбільшим числом представлені родини: Asphodelaceae – 120, Araceae – 117, Bromeliaceae – 115, Orchidaceae – 70,Agavaceae– 42, Arecaceae – 33.
До відділу Pinophyta належать 14 таксонів, до відділуCycadophyta – 13, до відділу Polypodiophyta – 25, до відділуLycopodiophyta – 3.

Серед найцінніших рослин колекції:

  • Agathis brownii (Lem.)L.H.Bailey (Araucariaceae)
  • Araucaria bidwillii Hook. (Araucariaceae)
  • Ceratozamia mexicana Brongn. (Zamiaceae)
  • Ceratozamia mexicana Brongn. var. longifolia (Miq.) Schuster (Zamiaceae)
  • Chrysophyllum imperialis (Lindl. ex K. Koch et Fint.) Hook.f. (Sapotaceae)
  • Cycas circinalis L. (Cycadaceae)
  • Dioon edule Lindl. (Zamiaceae)
  • Phoenix canariensis hort.ex Chabaud (Palmae)
  • та ряд інших рослин, що збереглися з передвоєнних часів і мають вік 100-150 років